استخدمت البشرية بذور الكتان لأكثر من 5000 عام لكن مؤخرا اكتشف المجتمع العلمي والطبي فوائدها الصحية الكثيرة، وهي تحتوي على أحماض دهنية أساسية ضرورية لاستمرار الحياة وهي: أوميغا 3، أوميغا 6 وجسم الإنسان لا يستطيع أن ينتج هذه الأحماض ولكن يحصل عليها من الطعام·

هذه الأحماض الدهنية أيضا ضرورية للمحافظة على النمو والتطور الطبيعي للمخ، وتكوّن غشاء الخلية، واستقلاب الكوليسترول والترايغليسيريد (وهي مركبات عضوية دهنية) وإنتاج الطاقة على مستوى الخلية·

بذر الكتان هو أغنى مصدر في الطبيعة لاحتوائه على مادة الليغنان النباتية، هذه المادة لها مفعول مضاد للبكتيريا والفيروسات والفطر، وحينما تختلط مادة الليغنان مع البكتيريا النافعة الموجودة في القولون، تتكون مركبات مضادة للاكسدة تشبه الهرمون تقوم بموازنة الهرمونات كهرمون الاستروجين·

بذور الكتان لها تأثير مسهل للأمعاء، ولذلك ينبغي استخدامها باعتدال وينبغي طحن بذور الكتان قبل تناولها، أو مضغها جيدا لكي يتمكن الجسم من الاستفادة منها، فعدم مضغها جيدا يقلل الاستفادة  الغذائية منها·

هناك نوعان من بذور الكتان: بذور الكتان البنية، وبذور الكتان الصفراء الذهبية وكلاهما له الفوائد الغذائىة نفسها·

ويستخدم طحين بذور الكتان بديلا للبيض عند صنع الكيك والمعجنات وهذه هي الطريقة: يوضع مقدار ملعقة كبيرة من طحين بذر الكتان في إناء عميق، ويضاف إليها 3 ملاعق كبيرة ماء، وتخلط معا، ثم تترك جانبا لمدة 3-2 دقائق، إذا أصبح المزيج كثيفا يكون جاهزا للاستعمال هذه الكمية تعادل بيضة واحدة·