حماة البيئة يحذرون من استهلاك هذه المواد ويرون أن لها مخاطر كبيرة على الإنسان والطبيعة، بينما يرى معظم علماء الوراثة وهندستها والكثير من الخبراء الاقتصاديين أنه لاضرر منها ولامفر من استخدامها على المدى البعيد من أجل سد احتياجات الغذاء العالمية بسبب الوتائر العالية لازدياد السكان، بل الانفجار السكاني، كما أنه لا مفر من مواجهة الأمراض والأوبئة لاسيما الأمراض المستعصية على الشفاء إلا عبر استخدام تقنيات الهندسة الوراثية، ويذهب البعض الآخر إلى اعتبار أن الاغذية والعضويات المعدلة وراثيا ستكون في المستقبل المنظور والبعيد العامل الأساسي في حماية البيئة لانها ستطور أنواعا ومحاصيل مقاومة للآفات الزراعية دون استخدام المبيدات الحشرية التي تشكل سموما تتراكم بكميات كبيرة في التربة وتؤذي الإنسان والحيوان والنبات على حد سواء، والتعديل الوراثي هو في الواقع التلاعب بمورثات عضويات أو خلايا بصورة تمنحها ميزات معينة كمقاومة الأمراض والآفات أو زيادة المحصول، وبالتالي الاستغناء عن استخدام مواد المبيدات الحشرية والأسمدة الكيميائية وهي مواد ضارة بالبيئة·